为了回答种种责难和疑惑，琴纳又于1799年陆续发表了关于牛痘接种的一系列文章。同行中，多数人持怀疑和否定的态度，也有少数人对他的发明产生了极大兴趣，其中就有伦敦两位著名的医生皮尔逊和伍德维尔。伍德维尔还发现牛痘接种者可以是未感染牛的传染源，为以后大量生产牛痘苗提供了依据。
琴纳的研究成果很快被译成德、法、荷、意和拉丁文在各国发表。由于琴纳牛痘接种法的推广，天花发病和死亡人数大大下降。英国政府终于承认这一创新的重大价值，1802年和1807年议会先后授予琴纳1万和3万英镑奖金；在伦敦建立了新的研究机构——皇家琴纳学会，由琴纳担任首任主席。在这里，琴纳将自己的全部精力投入到研究工作之中，团结和培养了许多青年研究者。
由于琴纳的牛痘接种法简便、安全而高效，十几年间迅速传遍欧洲各国和美洲大陆。1805年，牛痘接种法传入中国，逐渐取代了人痘接种。1803年，西班牙还特地派遣医疗船队向所有海外属地推广实施牛痘接种法，这一环球航行历时整整3年。当时英法是交战国，但琴纳的名字深受拿破仑的敬重，拿破仑称他是“人类的救星”。德国人把琴纳5月17日的生日作为盛大的节日来庆祝，举国上下载歌载舞，开怀痛饮，欢呼人类的新生。
1823年1月24日，琴纳去世，终年74岁。他的贡献并不限与战胜天花，更为重要的是，他证明疾病可以预防、传染病可以征服，是有史以来最伟大的乡村医生。
