他自以为对圣经有精确研究，他只认定他个人对圣经的看法，不容许别人也有神恩以解释圣经，他实在缺少了圣人的谦虚，他掘开了教会分裂的洪流，给信仰基督的世界造成了四百七十多年来长久分裂的遗憾。
与犹太人的关系
路德对犹太人的排斥对纳粹德国的历史影响有很大的争议。
1523年路德在《耶稣是一个犹太人》中强调耶稣是从神的人种中来。他将犹太人的社会上的隔离看作是「完善」犹太人的标志。他希望教会改革後犹太人更容易皈依为基督徒。但路德对犹太人对宗教改革的反应非常失望，他变了一个犹太敌人, 在《写给一个朋友反对犹太人的信》（1538年）和《犹太人和他们的谎言》（1543年）中：路德将犹太人与魔鬼置於一地，称他们为基督教最大的敌人，并引用新约中反犹太人的章节来证明他的观点。路德在《犹太人和他们的谎言》中写道：" 这些犹太人是如此的绝望、邪恶、毒意和被魔鬼所占据，1400年来他们是我们的疟疾、鼠疫和所有的不幸，而且还一直是。他们是真的魔鬼。假如我能够的话，我希望将他（犹太人）打倒在地上，在我的愤怒中用剑将他刺穿。是的，他们将我们（基督徒）束缚在我们自己的国土中，他们让我们劳汉耕作来赚得金钱和财产，而他们自己则坐在火炉後面偷懒、睡觉、烤洋梨、吃、喝、享受，用我们劳作来的财产，用他们的高利贷将我们和我们的财产束缚在他们的链子上，然後还嘲笑我们，对我们吐痰，让我们劳作，而他们却成了懒惰的地主……他们成了我们的主人，我们成了他们的仆人。"
他然後列出对待犹太人的七步计划：
●第一，燃烧犹太教堂和学校，所有无法烧的东西都埋到地里，这样无人可以再看到它的一砖一瓦。我们应该这样做，奉献给我们的主和整个基督社会，让神看到，我们是基督徒。
●第二，同样破坏和摧毁他们的住房，因为他们在他们的住房里做与在他们的学校里同样的事。然後象吉普赛人一样将他们圈在一个大厅或畜栏里，好让他们知道在我们的国土内他们不是主人。
●第三，没收所有他们的书和经书，因为在这些书里他们传播偶像崇拜、谎言、诅咒和对神的诽谤。
●第四，禁止他们的拉比教书。
●第五，不向犹太人提供保护，不许他们使用街道。
●第六，禁止他们放高利贷，没收他们的钱币和金银。
●第七，给年轻和健壮的犹太人镰刀、斧头、铲子、纺织机，让他们用自己的汗水赚他们的面包。
这七条今天看上去象是在号召後来纳粹针对犹太人施行的一些措施。而实际上希特勒只是劝他的党员人道一点而已。因此路德当时的动机非常可疑。为此路德会在前年要公开道歉, 可是主流基督教并没有任何回应。
路德和迫害巫婆
路德深信人可以与魔鬼达成协议、崇拜魔鬼和进行邪恶的魔术。因此赞成法庭惩罚巫师和巫婆。正如：旧约中的「行邪术的女人，不可容她存活。」（《出埃及记》22，18）。1526年5月6日路德在一次针对巫婆的布道中就引用了这句话。
他叙述了对巫术的深刻憎恶，对被怀疑的妇女的无情判决表示欢迎：" 处死女巫是正义的法律，因为她们会造成许多破坏，至今人们忽视了这些破坏。她们从其他人家里偷牛奶、奶油和所有的……她们将儿童变成别的东西……她们在人的膝盖中造成神秘的病，使得人身摧残……她们造成身心摧残，她们酿造魔剂和召唤魔鬼，散布仇恨、炙爱、坏天气和对房屋和田地的破坏，从一里以外或更远她们就可以射魔箭，而别人察觉不到……, 女巫必须被处死，因为她们是小偷、奸妇、强盗、杀人犯……她们破坏巨大。因此必须被处死，不只因为她们造成破坏，而因为她们与魔鬼接触"。 路德明确地赞成对黑魔术处死刑，而且这一点上特别敌对妇女。在上述布道中他五次说"她们必须被杀"。
