相反，我们却从史书的字里行间中窥见李世民为了篡夺皇位，一直在紧锣密鼓地筹划着。当李渊攻克长安后，将秦王府的幕僚遣往各地。其中包括杜如晦、房玄龄私下对李世民说：“若大王守藩端拱，无所用之，必欲经营四方，非此人莫可。”太宗大惊曰：“尔不言，几失此人。遂奏为府属。”当时正值李氏父子齐心协力建立新王朝之时，房玄龄早就看出李世民在觊觎皇位。
李渊到底想不想立李世民为太子？
正史关于高祖李渊对玄武门政变的态度，也是前后矛盾，这集中反映在对太子废立的态度上。正史在记载太原起兵上，将李渊描述得如何优柔寡断与不识时务，而在太子废立上却一反常态，把李渊说成很有远见，他早就有移太子位于李世民的打算。李世民取得皇位后曾这样说过：“武德末，太上皇有废立之议，顾朕挟不赏之功，于昆弟弗见容。”于是，“私许立为太子”。似乎高祖始终站在秦王一方。这实属一面之词。平心而论，在关于皇嗣继承上，高祖始终无废立的打算。政变前夕，高祖还对李世民说：“建成年长，为嗣日久，吾不忍夺也。”当李渊看清了李世民夺嫡自代的急切心情后，即指责其行动，并决定将其安置洛阳。至此，我们完全清楚了高祖对建成、世民两兄弟的真实态度，他不希望其兄弟间相互厮杀，尽量调解矛盾，始终无废立太子的意图。
而六月四日杀兄戮弟后，意味着李世民夺取皇位完成了紧要的一步，下面该轮到逼父皇让位了。为了缓和社会舆论，先让高祖当傀儡皇帝，两个月后竟演起了“内禅”剧。曹丕代汉也由禅让达到，史功“帝升坛礼毕，顾谓群臣曰：舜尧之事，吾知乏矣”。对禅让内幕直言不讳。宋人吕夏卿说，李世民杀李建成后，“内禅之命行焉”。这里所谓的内禅，无非是持高祖软禁后进而逼其退位的代名词而已。早在六月四日，尉迟敬德奉秦王李世民“请降手谕，令诸军并受秦王处分。上从之”。泰王已成了实际上的皇帝，“内禅”只待履行手续而已。
由上可知，正史关于太原起兵、玄武门之变原因以及高祖对大子废立态度等一系列记载，均与历史真相相距甚远。正史记载之所以出现漏洞，是因为取材于太宗君臣篡改过的史料，这些史料是本着为玄武门政变进行辩解，为太宗的即位制造名正言顺的舆论。既然篡改了真相，难免不留下痕迹，甚至颇有掩耳盗铃之嫌。
